refactor: 整理文件夹结构，修复 create_serde 导入问题

- 移动 main_graph/tools/ 到 deprecated/main_graph_tools/（旧架构工具）
- 移动 rag_initializer.py 和 retry_utils.py 到 core/
- 清理 main_graph/nodes/ 里的旧节点到 deprecated/
- 修复 backend.py 中 create_serde 导入问题

backend/app/deprecated/main_graph_tools/graph_tools.py

@@ -0,0 +1,25 @@
+"""
+工具定义模块 - 子图工具 + RAG 工具 + 公共工具
+Subgraph Tools + RAG Tools + Common Tools
+"""
+
+# 子图工具
+from .subgraph_tools import (
+    SUBGRAPH_TOOLS,
+    SUBGRAPH_TOOLS_BY_NAME,
+    dictionary_tool,
+    news_analysis_tool,
+    contact_tool
+)
+
+# 公共工具
+from .common_tools import (
+    COMMON_TOOLS,
+    COMMON_TOOLS_BY_NAME,
+    web_search_tool,
+    generate_chart_tool
+)
+
+# 工具列表和映射（全局常量）
+AVAILABLE_TOOLS = SUBGRAPH_TOOLS.copy() + COMMON_TOOLS.copy()
+TOOLS_BY_NAME = {**SUBGRAPH_TOOLS_BY_NAME, **COMMON_TOOLS_BY_NAME}